RefWorks-tilille voi tehdä erillisiä osioita, joita kutsutaan projekteiksi.
Write-n-cite:n uusimmassa versiossa (4.6.59) voi Change Project -toiminnon avulla siirtyä käyttämään eri projektien viitteitä.
Projektien jakaminen mahdollistaa Word-tiedostojen ja RefWorks-viitetietojen yhteiskäytön. Ks. ohje Jaettujen Word-tiedostojen ja Refworks-viitetietojen yhteiskäyttö -välilehdeltä.
Projektien välillä viitetietoja siirretään export-import -toiminnolla.